Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MVDP53602 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MVDP53602 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MVDP53602 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MVDP53602 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MVDP53602 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MVDP53602 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MVDP53602 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVDP53602 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVDP53602 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVDP53602 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MVDP53602 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MVDP53602 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVDP53602 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVDP53602 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVDP53602 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVDP53602 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MVDP53602 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MVDP53602 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVDP53602 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVDP53602 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVDP53602 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVDP53602 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVDP53602 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MVDP53602 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MVDP53602 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVDP53602 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVDP53602 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVDP53602 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVDP53602 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVDP53602 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MVDP53602 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVDP53602 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVDP53602 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVDP53602 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MVDP53602 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVDP53602 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVDP53602 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVDP53602 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVDP53602 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVDP53602 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
MVDP53602 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVDP53602 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVDP53602 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVDP53602 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVDP53602 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVDP53602 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MVDP53602 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MVDP53602 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MVDP53602 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MVDP53602 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms