Protein–RNA interactions for Protein: P53044

UFD1, Ubiquitin fusion degradation protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UFD1P53044 YKR041WYKR041W 753 nt4.79□□□□□ -1.64
UFD1P53044 RPS15YOL040C 429 nt4.79□□□□□ -1.64
UFD1P53044 TOS3YGL179C 1683 nt4.79□□□□□ -1.64
UFD1P53044 GLT1YDL171C 6438 nt4.79□□□□□ -1.64
UFD1P53044 RPT4YOR259C 1314 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 NSI1YDR026C 1713 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 AFT1YGL071W 2073 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 GDB1YPR184W 4611 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 ENP1YBR247C 1452 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 YDL172CYDL172C 480 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 PAN6YIL145C 930 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 RPO26YPR187W 468 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 SSZ1YHR064C 1617 nt4.78□□□□□ -1.64
UFD1P53044 MTF2YDL044C 1323 nt4.77□□□□□ -1.65
UFD1P53044 GRS1YBR121C 2004 nt4.77□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YMR155WYMR155W 1644 nt4.77□□□□□ -1.65
UFD1P53044 ORM1YGR038W 669 nt4.77□□□□□ -1.65
UFD1P53044 CBP4YGR174C 513 nt4.77□□□□□ -1.65
UFD1P53044 BPL1YDL141W 2073 nt4.77□□□□□ -1.65
UFD1P53044 RPT2YDL007W 1314 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YDL121CYDL121C 450 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SYF2YGR129W 648 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YIL067CYIL067C 2037 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 ATG17YLR423C 1254 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YMR027WYMR027W 1413 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SNO4YMR322C 714 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 HSP33YOR391C 714 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 HSP32YPL280W 714 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 ADE6YGR061C 4077 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 TRK2YKR050W 2670 nt4.76□□□□□ -1.65
UFD1P53044 NRD1YNL251C 1728 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SNF3YDL194W 2655 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 BNS1YGR230W 414 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 MRPL15YLR312W-A 762 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YPL102CYPL102C 303 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 UGO1YDR470C 1509 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 MET7YOR241W 1647 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SHM1YBR263W 1473 nt4.75□□□□□ -1.65
UFD1P53044 ACF2YLR144C 2340 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SMF3YLR034C 1422 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 TUL1YKL034W 2277 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YTA6YPL074W 2265 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YDR401WYDR401W 564 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 RPT6YGL048C 1218 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 MRF1YGL143C 1242 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 NCS6YGL211W 1080 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 NQM1YGR043C 1002 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YML101C-AYML101C-A 318 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 MTQ1YNL063W 945 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SEC9YGR009C 1956 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YOR1YGR281W 4434 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 HFI1YPL254W 1467 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 FET3YMR058W 1911 nt4.74□□□□□ -1.65
UFD1P53044 UTP7YER082C 1665 nt4.73□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YDR154CYDR154C 351 nt4.73□□□□□ -1.65
UFD1P53044 MTC2YKL098W 1074 nt4.73□□□□□ -1.65
UFD1P53044 HLJ1YMR161W 675 nt4.73□□□□□ -1.65
UFD1P53044 PRP43YGL120C 2304 nt4.73□□□□□ -1.65
UFD1P53044 HXT3YDR345C 1704 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 PXA1YPL147W 2613 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YDL119CYDL119C 924 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 PGA3YML125C 939 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SPG4YMR107W 348 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 YBL044WYBL044W 369 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 TEF1YPR080W 1377 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 TEF2YBR118W 1377 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 SIT1YEL065W 1887 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 FOL1YNL256W 2475 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 RSC30YHR056C 2652 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 AVO1YOL078W 3531 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 CDC19YAL038W 1503 nt4.72□□□□□ -1.65
UFD1P53044 PHO90YJL198W 2646 nt4.71□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YDL144CYDL144C 1071 nt4.71□□□□□ -1.66
UFD1P53044 RML2YEL050C 1182 nt4.71□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YJL211CYJL211C 444 nt4.71□□□□□ -1.66
UFD1P53044 BUB3YOR026W 1026 nt4.71□□□□□ -1.66
UFD1P53044 SHE10YGL228W 1734 nt4.71□□□□□ -1.66
UFD1P53044 DEF1YKL054C 2217 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 SSY5YJL156C 2100 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 KCH1YJR054W 1494 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 IES1YFL013C 2079 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 MTQ2YDR140W 666 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 SWP1YMR149W 861 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 CSL4YNL232W 879 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 NPL6YMR091C 1308 nt4.7□□□□□ -1.66
UFD1P53044 VHS1YDR247W 1386 nt4.69□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YDR541CYDR541C 1035 nt4.69□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt4.69□□□□□ -1.66
UFD1P53044 ZRT1YGL255W 1131 nt4.69□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YNR048WYNR048W 1182 nt4.69□□□□□ -1.66
UFD1P53044 YFL034WYFL034W 3222 nt4.69□□□□□ -1.66
UFD1P53044 SEG2YKL105C 3399 nt4.68□□□□□ -1.66
UFD1P53044 GPR1YDL035C 2886 nt4.68□□□□□ -1.66
UFD1P53044 MTW1YAL034W-A 870 nt4.68□□□□□ -1.66
UFD1P53044 MRPL22YNL177C 930 nt4.68□□□□□ -1.66
UFD1P53044 PIN2YOR104W 849 nt4.68□□□□□ -1.66
UFD1P53044 BRL1YHR036W 1416 nt4.68□□□□□ -1.66
UFD1P53044 RAT1YOR048C 3021 nt4.68□□□□□ -1.66
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