Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLCSP50747 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLCSP50747 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLCSP50747 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLCSP50747 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLCSP50747 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLCSP50747 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLCSP50747 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLCSP50747 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLCSP50747 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLCSP50747 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLCSP50747 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLCSP50747 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLCSP50747 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLCSP50747 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLCSP50747 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLCSP50747 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLCSP50747 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLCSP50747 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLCSP50747 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLCSP50747 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLCSP50747 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLCSP50747 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms