Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLK1P49759 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLK1P49759 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK1P49759 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK1P49759 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLK1P49759 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLK1P49759 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLK1P49759 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLK1P49759 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLK1P49759 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK1P49759 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK1P49759 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK1P49759 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLK1P49759 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CLK1P49759 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CLK1P49759 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CLK1P49759 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK1P49759 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK1P49759 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK1P49759 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK1P49759 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CLK1P49759 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CLK1P49759 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK1P49759 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CLK1P49759 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms