Protein–RNA interactions for Protein: P49754

VPS41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS41P49754 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS41P49754 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS41P49754 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS41P49754 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VPS41P49754 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS41P49754 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS41P49754 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VPS41P49754 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS41P49754 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS41P49754 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS41P49754 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS41P49754 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS41P49754 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VPS41P49754 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VPS41P49754 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VPS41P49754 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS41P49754 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS41P49754 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS41P49754 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VPS41P49754 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VPS41P49754 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS41P49754 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS41P49754 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS41P49754 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS41P49754 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
VPS41P49754 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS41P49754 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS41P49754 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS41P49754 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS41P49754 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VPS41P49754 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.43
VPS41P49754 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VPS41P49754 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VPS41P49754 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS41P49754 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS41P49754 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VPS41P49754 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VPS41P49754 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VPS41P49754 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VPS41P49754 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms