Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
HOXA1P49639 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HOXA1P49639 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXA1P49639 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms