Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRPC1P48995 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRPC1P48995 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRPC1P48995 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms