Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GABRA4P48169 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GABRA4P48169 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GABRA4P48169 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms