Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GNPDA1P46926 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GNPDA1P46926 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms