Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RPL35P42766 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RPL35P42766 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RPL35P42766 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RPL35P42766 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RPL35P42766 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RPL35P42766 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms