Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
TMPOP42166 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
TMPOP42166 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
TMPOP42166 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMPOP42166 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMPOP42166 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
TMPOP42166 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
TMPOP42166 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMPOP42166 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMPOP42166 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMPOP42166 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
TMPOP42166 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMPOP42166 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMPOP42166 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMPOP42166 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
TMPOP42166 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
TMPOP42166 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
TMPOP42166 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
TMPOP42166 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
TMPOP42166 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMPOP42166 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMPOP42166 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMPOP42166 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMPOP42166 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMPOP42166 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
TMPOP42166 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
TMPOP42166 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMPOP42166 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMPOP42166 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
TMPOP42166 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMPOP42166 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
TMPOP42166 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMPOP42166 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMPOP42166 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
TMPOP42166 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMPOP42166 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMPOP42166 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMPOP42166 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMPOP42166 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
TMPOP42166 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMPOP42166 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMPOP42166 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMPOP42166 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMPOP42166 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMPOP42166 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
TMPOP42166 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
TMPOP42166 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMPOP42166 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMPOP42166 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
TMPOP42166 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
TMPOP42166 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
TMPOP42166 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMPOP42166 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMPOP42166 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.6■■■□□ 2.49
TMPOP42166 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TMPOP42166 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
TMPOP42166 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMPOP42166 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMPOP42166 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
TMPOP42166 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms