Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MDH1P40925 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH1P40925 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH1P40925 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH1P40925 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH1P40925 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MDH1P40925 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MDH1P40925 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MDH1P40925 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDH1P40925 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
MDH1P40925 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
MDH1P40925 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MDH1P40925 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MDH1P40925 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MDH1P40925 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MDH1P40925 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MDH1P40925 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDH1P40925 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MDH1P40925 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MDH1P40925 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MDH1P40925 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146 ms