Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL1P40616 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ARL1P40616 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARL1P40616 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ARL1P40616 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARL1P40616 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL1P40616 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL1P40616 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL1P40616 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL1P40616 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARL1P40616 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ARL1P40616 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL1P40616 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL1P40616 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL1P40616 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARL1P40616 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL1P40616 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ARL1P40616 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARL1P40616 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARL1P40616 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARL1P40616 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARL1P40616 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARL1P40616 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARL1P40616 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms