Protein–RNA interactions for Protein: P40318

SSM4, ERAD-associated E3 ubiquitin-protein ligase DOA10, yeastyeast

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Length 1,319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSM4P40318 YBR226CYBR226C 411 nt7.37□□□□□ -1.23
SSM4P40318 STE50YCL032W 1041 nt7.37□□□□□ -1.23
SSM4P40318 NAG1YGR031C-A 492 nt7.36□□□□□ -1.23
SSM4P40318 YML057C-AYML057C-A 390 nt7.36□□□□□ -1.23
SSM4P40318 SNT2YGL131C 4212 nt7.36□□□□□ -1.23
SSM4P40318 DAL7YIR031C 1665 nt7.35□□□□□ -1.23
SSM4P40318 MCM6YGL201C 3054 nt7.35□□□□□ -1.23
SSM4P40318 ERD1YDR414C 1089 nt7.35□□□□□ -1.23
SSM4P40318 BNS1YGR230W 414 nt7.35□□□□□ -1.23
SSM4P40318 NOT3YIL038C 2511 nt7.35□□□□□ -1.23
SSM4P40318 EHD3YDR036C 1503 nt7.35□□□□□ -1.23
SSM4P40318 CAM1YPL048W 1248 nt7.34□□□□□ -1.23
SSM4P40318 CDC16YKL022C 2523 nt7.34□□□□□ -1.23
SSM4P40318 VID30YGL227W 2877 nt7.34□□□□□ -1.24
SSM4P40318 RRP45YDR280W 918 nt7.33□□□□□ -1.24
SSM4P40318 RPA49YNL248C 1248 nt7.33□□□□□ -1.24
SSM4P40318 VHS1YDR247W 1386 nt7.33□□□□□ -1.24
SSM4P40318 YJL107CYJL107C 1164 nt7.31□□□□□ -1.24
SSM4P40318 RPB4YJL140W 666 nt7.31□□□□□ -1.24
SSM4P40318 ISU2YOR226C 471 nt7.31□□□□□ -1.24
SSM4P40318 GFA1YKL104C 2154 nt7.31□□□□□ -1.24
SSM4P40318 TOM5YPR133W-A 153 nt7.3□□□□□ -1.24
SSM4P40318 TOS2YGR221C 1869 nt7.3□□□□□ -1.24
SSM4P40318 BPL1YDL141W 2073 nt7.3□□□□□ -1.24
SSM4P40318 ATG33YLR356W 594 nt7.29□□□□□ -1.24
SSM4P40318 RPL3YOR063W 1164 nt7.29□□□□□ -1.24
SSM4P40318 GDA1YEL042W 1557 nt7.29□□□□□ -1.24
SSM4P40318 THP1YOL072W 1368 nt7.29□□□□□ -1.24
SSM4P40318 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.28□□□□□ -1.24
SSM4P40318 MPM1YJL066C 759 nt7.28□□□□□ -1.24
SSM4P40318 NIT2YJL126W 924 nt7.28□□□□□ -1.24
SSM4P40318 YKR041WYKR041W 753 nt7.28□□□□□ -1.24
SSM4P40318 CYC8YBR112C 2901 nt7.28□□□□□ -1.24
SSM4P40318 YCR061WYCR061W 1896 nt7.28□□□□□ -1.24
SSM4P40318 YJL171CYJL171C 1191 nt7.27□□□□□ -1.24
SSM4P40318 YJL211CYJL211C 444 nt7.27□□□□□ -1.24
SSM4P40318 SCW10YMR305C 1170 nt7.27□□□□□ -1.24
SSM4P40318 FUI1YBL042C 1920 nt7.27□□□□□ -1.25
SSM4P40318 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt7.27□□□□□ -1.25
SSM4P40318 RRP46YGR095C 672 nt7.27□□□□□ -1.25
SSM4P40318 XPT1YJR133W 630 nt7.27□□□□□ -1.25
SSM4P40318 MRL1YPR079W 1146 nt7.26□□□□□ -1.25
SSM4P40318 MDG1YNL173C 1101 nt7.25□□□□□ -1.25
SSM4P40318 ELP3YPL086C 1674 nt7.24□□□□□ -1.25
SSM4P40318 PDI1YCL043C 1569 nt7.24□□□□□ -1.25
SSM4P40318 PRS1YKL181W 1284 nt7.24□□□□□ -1.25
SSM4P40318 ECM15YBL001C 315 nt7.24□□□□□ -1.25
SSM4P40318 YIL067CYIL067C 2037 nt7.23□□□□□ -1.25
SSM4P40318 NGR1YBR212W 2019 nt7.23□□□□□ -1.25
SSM4P40318 TUB2YFL037W 1374 nt7.23□□□□□ -1.25
SSM4P40318 EEB1YPL095C 1371 nt7.23□□□□□ -1.25
SSM4P40318 YEN1YER041W 2280 nt7.22□□□□□ -1.25
SSM4P40318 CUE2YKL090W 1332 nt7.21□□□□□ -1.25
SSM4P40318 VHT1YGR065C 1782 nt7.21□□□□□ -1.26
SSM4P40318 YOR342CYOR342C 960 nt7.21□□□□□ -1.26
SSM4P40318 YEL053W-AYEL053W-A 348 nt7.2□□□□□ -1.26
SSM4P40318 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt7.2□□□□□ -1.26
SSM4P40318 ORM1YGR038W 669 nt7.2□□□□□ -1.26
SSM4P40318 GEP5YLR091W 882 nt7.2□□□□□ -1.26
SSM4P40318 ATP4YPL078C 735 nt7.19□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SSY5YJL156C 2100 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 NSG1YHR133C 876 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SPL2YHR136C 447 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 YAL044W-AYAL044W-A 333 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 CUE5YOR042W 1236 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 FEX1YOR390W 1128 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 FEX2YPL279C 1128 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 HXT4YHR092C 1731 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 RPT2YDL007W 1314 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 NPL6YMR091C 1308 nt7.18□□□□□ -1.26
SSM4P40318 YEL077CYEL077C 3834 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 THI5YFL058W 1023 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SWP1YMR149W 861 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 THI12YNL332W 1023 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 MRI1YPR118W 1236 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 ZUO1YGR285C 1302 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 ARB1YER036C 1833 nt7.17□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SYG1YIL047C 2709 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SMC5YOL034W 3282 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 NOP8YOL144W 1455 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 DRN1YGR093W 1524 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 YNG2YHR090C 849 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 FUN19YAL034C 1242 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 snR10snR10 245 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SIA1YOR137C 1869 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 BZZ1YHR114W 1902 nt7.16□□□□□ -1.26
SSM4P40318 MMT2YPL224C 1455 nt7.15□□□□□ -1.26
SSM4P40318 MKK2YPL140C 1521 nt7.15□□□□□ -1.26
SSM4P40318 SER33YIL074C 1410 nt7.15□□□□□ -1.27
SSM4P40318 UBA3YPR066W 900 nt7.14□□□□□ -1.27
SSM4P40318 VTC2YFL004W 2487 nt7.14□□□□□ -1.27
SSM4P40318 SLT2YHR030C 1455 nt7.14□□□□□ -1.27
SSM4P40318 BIT2YBR270C 1638 nt7.13□□□□□ -1.27
SSM4P40318 PUS6YGR169C 1215 nt7.13□□□□□ -1.27
SSM4P40318 OST3YOR085W 1053 nt7.13□□□□□ -1.27
SSM4P40318 BRE2YLR015W 1518 nt7.13□□□□□ -1.27
SSM4P40318 ETT1YOR051C 1239 nt7.12□□□□□ -1.27
SSM4P40318 MGR2YPL098C 342 nt7.12□□□□□ -1.27
SSM4P40318 UGA2YBR006W 1494 nt7.12□□□□□ -1.27
SSM4P40318 ABZ1YNR033W 2364 nt7.12□□□□□ -1.27
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