Protein–RNA interactions for Protein: P38302

NTC20, Pre-mRNA-splicing factor NTC20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NTC20P38302 VHS2YIL135C 1311 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 SPO74YGL170C 1242 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 NPA3YJR072C 1158 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YLR346CYLR346C 306 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 HAP3YBL021C 435 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YMR295CYMR295C 594 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ICL1YER065C 1674 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 MRC1YCL061C 3291 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 SOG2YOR353C 2376 nt5.07□□□□□ -1.6
NTC20P38302 CYK3YDL117W 2658 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 IRC7YFR055W 1023 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YGR011WYGR011W 327 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 RPE1YJL121C 717 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 RPS28AYOR167C 204 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ARN1YHL040C 1884 nt5.06□□□□□ -1.6
NTC20P38302 RIM101YHL027W 1878 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ELP2YGR200C 2367 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YDL218WYDL218W 954 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YGR122WYGR122W 1209 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ECM1YAL059W 639 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YBL029WYBL029W 1131 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YNL285WYNL285W 372 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 CAR1YPL111W 1002 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 MRL1YPR079W 1146 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 SEC9YGR009C 1956 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 HXT3YDR345C 1704 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 RKM4YDR257C 1485 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 SPO77YLR341W 1434 nt5.05□□□□□ -1.6
NTC20P38302 VHS1YDR247W 1386 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 KRS1YDR037W 1776 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 DSF1YEL070W 1509 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YNR073CYNR073C 1509 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 RPN11YFR004W 921 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 KSS1YGR040W 1107 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YJR085CYJR085C 318 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YOR289WYOR289W 756 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ATG4YNL223W 1485 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 FPK1YNR047W 2682 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 MCX1YBR227C 1563 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 SMP1YBR182C 1359 nt5.04□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ACC1YNR016C 6702 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 CLD1YGR110W 1338 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 SIS2YKR072C 1689 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 VPS5YOR069W 2028 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 YDL121CYDL121C 450 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 MMS2YGL087C 414 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 RNH201YNL072W 924 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 ADE3YGR204W 2841 nt5.03□□□□□ -1.6
NTC20P38302 PCL10YGL134W 1302 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 GSH2YOL049W 1476 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YER134CYER134C 537 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 GRX4YER174C 735 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 HAP2YGL237C 798 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YKR104WYKR104W 921 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 PAU17YLL025W 375 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YLR463CYLR463C 552 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YML018CYML018C 1182 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 JNM1YMR294W 1122 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 SPS18YNL204C 903 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 FSF1YOR271C 984 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 VMA4YOR332W 702 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YPR109WYPR109W 885 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 MCM3YEL032W 2916 nt5.02□□□□□ -1.61
NTC20P38302 IXR1YKL032C 1794 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YDL129WYDL129W 876 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 RPL7AYGL076C 735 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YJL107CYJL107C 1164 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YKL031WYKL031W 414 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 RPL10YLR075W 666 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 NCE103YNL036W 666 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YPL071CYPL071C 471 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 RPL7BYPL198W 735 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 RAD24YER173W 1980 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 GAT1YFL021W 1533 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 MET3YJR010W 1536 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 UBP7YIL156W 3216 nt5.01□□□□□ -1.61
NTC20P38302 VTH1YIL173W 4650 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 VTH2YJL222W 4650 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 SNZ3YFL059W 897 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YHL018WYHL018W 363 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 SUP19tS(UGA)E 82 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 SUP17tS(UGA)I 82 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 SUP16tS(UGA)P 82 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YIL028WYIL028W 399 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YJU3YKL094W 942 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YKR075CYKR075C 924 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 DSE3YOR264W 1293 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 RFT1YBL020W 1725 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 PCL8YPL219W 1479 nt5□□□□□ -1.61
NTC20P38302 YER186CYER186C 921 nt4.99□□□□□ -1.61
NTC20P38302 LEU5YHR002W 1074 nt4.99□□□□□ -1.61
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