Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2IP36954 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POLR2IP36954 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
POLR2IP36954 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms