Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
TGFBR1P36897 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
TGFBR1P36897 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
TGFBR1P36897 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms