Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SFTPDP35247 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SFTPDP35247 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SFTPDP35247 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms