Protein–RNA interactions for Protein: P35226

BMI1, Polycomb complex protein BMI-1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMI1P35226 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BMI1P35226 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BMI1P35226 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMI1P35226 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMI1P35226 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMI1P35226 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMI1P35226 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BMI1P35226 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BMI1P35226 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BMI1P35226 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BMI1P35226 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BMI1P35226 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BMI1P35226 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms