Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSF2RBP32927 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CSF2RBP32927 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CSF2RBP32927 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms