Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBP1P32455 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP1P32455 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP1P32455 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP1P32455 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBP1P32455 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBP1P32455 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBP1P32455 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBP1P32455 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBP1P32455 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBP1P32455 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBP1P32455 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GBP1P32455 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GBP1P32455 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GBP1P32455 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP1P32455 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP1P32455 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP1P32455 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP1P32455 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GBP1P32455 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GBP1P32455 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms