Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
OTX1P32242 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
OTX1P32242 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
OTX1P32242 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
OTX1P32242 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
OTX1P32242 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
OTX1P32242 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
OTX1P32242 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
OTX1P32242 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
OTX1P32242 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
OTX1P32242 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms