Protein–RNA interactions for Protein: P31937

HIBADH, 3-hydroxyisobutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIBADHP31937 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HIBADHP31937 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HIBADHP31937 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HIBADHP31937 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms