Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXC13P31276 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXC13P31276 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms