Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXA7P31268 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HOXA7P31268 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXA7P31268 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXA7P31268 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms