Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CLIP1P30622 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.43■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.38■■■■□ 3.58
CLIP1P30622 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.57
CLIP1P30622 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
CLIP1P30622 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC37.22■■■■□ 3.55
CLIP1P30622 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms