Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARID4AP29374 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARID4AP29374 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ARID4AP29374 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms