Protein–RNA interactions for Protein: P26640

VARS, Valine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARSP26640 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VARSP26640 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VARSP26640 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VARSP26640 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VARSP26640 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VARSP26640 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
VARSP26640 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VARSP26640 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
VARSP26640 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VARSP26640 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VARSP26640 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VARSP26640 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARSP26640 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARSP26640 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARSP26640 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARSP26640 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARSP26640 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VARSP26640 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VARSP26640 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VARSP26640 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
VARSP26640 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARSP26640 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARSP26640 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARSP26640 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VARSP26640 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms