Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSRP1P21291 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CSRP1P21291 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CSRP1P21291 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms