Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3BP20337 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3BP20337 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms