Protein–RNA interactions for Protein: P19388

POLR2E, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2EP19388 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
POLR2EP19388 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
POLR2EP19388 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
POLR2EP19388 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms