Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHN1P15882 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHN1P15882 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHN1P15882 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHN1P15882 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHN1P15882 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHN1P15882 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHN1P15882 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHN1P15882 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHN1P15882 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHN1P15882 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHN1P15882 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHN1P15882 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHN1P15882 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHN1P15882 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHN1P15882 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHN1P15882 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHN1P15882 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHN1P15882 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHN1P15882 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHN1P15882 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHN1P15882 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHN1P15882 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHN1P15882 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHN1P15882 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHN1P15882 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms