Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BRAFP15056 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BRAFP15056 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
BRAFP15056 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRAFP15056 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRAFP15056 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
BRAFP15056 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRAFP15056 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
BRAFP15056 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRAFP15056 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRAFP15056 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRAFP15056 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
BRAFP15056 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BRAFP15056 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRAFP15056 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRAFP15056 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRAFP15056 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BRAFP15056 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRAFP15056 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRAFP15056 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
BRAFP15056 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRAFP15056 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRAFP15056 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRAFP15056 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BRAFP15056 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRAFP15056 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRAFP15056 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRAFP15056 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BRAFP15056 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
BRAFP15056 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
BRAFP15056 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRAFP15056 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRAFP15056 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRAFP15056 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BRAFP15056 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRAFP15056 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRAFP15056 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRAFP15056 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRAFP15056 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
BRAFP15056 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BRAFP15056 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BRAFP15056 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BRAFP15056 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms