Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRP12270 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRP12270 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRP12270 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRP12270 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRP12270 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRP12270 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRP12270 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRP12270 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRP12270 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRP12270 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRP12270 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRP12270 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRP12270 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRP12270 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRP12270 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRP12270 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPRP12270 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPRP12270 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TPRP12270 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPRP12270 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRP12270 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRP12270 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRP12270 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRP12270 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRP12270 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRP12270 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRP12270 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRP12270 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRP12270 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRP12270 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRP12270 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRP12270 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms