Protein–RNA interactions for Protein: P0CB48

UBTFL6, Putative upstream-binding factor 1-like protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBTFL6P0CB48 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBTFL6P0CB48 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UBTFL6P0CB48 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UBTFL6P0CB48 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms