Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ABCB1P08183 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ABCB1P08183 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ABCB1P08183 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms