Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CENPBP07199 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CENPBP07199 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CENPBP07199 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CENPBP07199 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CENPBP07199 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPBP07199 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPBP07199 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPBP07199 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CENPBP07199 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CENPBP07199 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CENPBP07199 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CENPBP07199 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CENPBP07199 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CENPBP07199 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CENPBP07199 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CENPBP07199 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CENPBP07199 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CENPBP07199 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CENPBP07199 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CENPBP07199 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CENPBP07199 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CENPBP07199 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CENPBP07199 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CENPBP07199 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CENPBP07199 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPBP07199 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPBP07199 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPBP07199 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPBP07199 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPBP07199 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CENPBP07199 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CENPBP07199 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CENPBP07199 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CENPBP07199 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.69
CENPBP07199 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CENPBP07199 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms