Protein–RNA interactions for Protein: P01033

TIMP1, Metalloproteinase inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP1P01033 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TIMP1P01033 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TIMP1P01033 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TIMP1P01033 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms