Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ALDH1A2O94788 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ALDH1A2O94788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALDH1A2O94788 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms