Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRCPO75575 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRCPO75575 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRCPO75575 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRCPO75575 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRCPO75575 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRCPO75575 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CRCPO75575 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CRCPO75575 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CRCPO75575 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRCPO75575 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRCPO75575 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRCPO75575 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRCPO75575 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CRCPO75575 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CRCPO75575 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms