Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PMPCBO75439 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PMPCBO75439 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PMPCBO75439 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PMPCBO75439 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms