Protein–RNA interactions for Protein: O60602

TLR5, Toll-like receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR5O60602 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR5O60602 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR5O60602 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR5O60602 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TLR5O60602 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR5O60602 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR5O60602 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR5O60602 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TLR5O60602 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TLR5O60602 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TLR5O60602 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TLR5O60602 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TLR5O60602 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TLR5O60602 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TLR5O60602 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TLR5O60602 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR5O60602 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR5O60602 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TLR5O60602 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR5O60602 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR5O60602 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR5O60602 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR5O60602 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR5O60602 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TLR5O60602 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TLR5O60602 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR5O60602 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TLR5O60602 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms