Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOBOXO60393 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NOBOXO60393 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOBOXO60393 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms