Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
EDIL3O43854 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
EDIL3O43854 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDIL3O43854 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDIL3O43854 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms