Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RRP9O43818 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RRP9O43818 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP9O43818 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP9O43818 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP9O43818 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP9O43818 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RRP9O43818 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RRP9O43818 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP9O43818 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP9O43818 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP9O43818 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP9O43818 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RRP9O43818 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP9O43818 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP9O43818 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP9O43818 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP9O43818 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RRP9O43818 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP9O43818 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP9O43818 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP9O43818 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RRP9O43818 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RRP9O43818 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP9O43818 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP9O43818 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP9O43818 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RRP9O43818 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RRP9O43818 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RRP9O43818 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RRP9O43818 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP9O43818 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP9O43818 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RRP9O43818 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RRP9O43818 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP9O43818 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP9O43818 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RRP9O43818 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP9O43818 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP9O43818 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP9O43818 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP9O43818 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP9O43818 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RRP9O43818 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms