Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LANCL1O43813 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
LANCL1O43813 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms