Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC7A4O43246 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC7A4O43246 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC7A4O43246 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms