Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
POLR1CO15160 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLR1CO15160 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms