Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ANKRD28O15084 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ANKRD28O15084 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ANKRD28O15084 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms