Protein–RNA interactions for Protein: O00762

UBE2C, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CO00762 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2CO00762 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBE2CO00762 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBE2CO00762 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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